魔法使いアガニムは七賢者の子孫を誘拐し、彼らの力を使って闇の世界へと続く結界を破壊しようと企んでいる。その子孫の一人、ゼルダ姫はリンクに窮状を告げる。頼れる剣と盾を携えたリンクは、危険な地へと続く旅に出る。