『ピクミン2』では、オリマー船長がかつて漂着した惑星に戻り、経営難に陥った会社のために、故郷で販売するための小物を集めます。本作には2キャラクターシステムが搭載されており、プレイヤーは2人の宇宙飛行士を切り替えながらアイテムを集めることができます。2人協力プレイのチャレンジミッションや対戦モードも用意されています。