惑星リップルスターには、優しく平和な妖精たちが暮らしています。この惑星は、リップルスターを見守るグレートクリスタルの力によって、危険から守られています。しかし、この力はダークマターの注意を引きつけ、ダークマターはグレートクリスタルを悪の計画に利用しようとします。巨大な塊がクリスタルを襲撃し、探し求めます。空は暗黒に染まり、妖精たちはパニックに陥ります。ダークマターの脅威に対抗するため、リップルスターの女王はリボンという名の妖精にクリスタルを安全な場所へ運ぶよう命じます。リボンはクリスタルを引っ張って飛び立とうとしますが、ダークマターが放った3つのオーブによって阻まれます。クリスタルは74の破片に砕け散り、いくつかの惑星に散らばり、リボンはポップスター星に墜落します。カービィは破片の一つを見つけ、リボンに渡します。二人は残りの破片を探しに出発します。カービィたちがすべてのクリスタルの破片を集め、ミラクルマターを倒すと、ダークマターはリップルスターから逃げ出し、爆発します。しかし、クリスタルが妖精の女王の体内に強力なダークマターエネルギーを感知し、それを放出。惑星全体にダークスターが出現したため、勝利はあっけなく終わった。カービィたちはダークスターに潜入し、デデデ大王に見放されたカービィたちは02に挑むため宇宙へ飛び立った。シャードガンを装備したカービィとリボンは、02とダークスターを破壊した。