電脳戦機バーチャロン： このゲームの舞台は、地球が企業シンジケートに支配されているディストピア的な未来世界です。彼らの支配から逃れようとする人々は、他の惑星へと移住していきます。これらのコロニーの一つで、絶滅した種族が使用していた強力な技術が発見されます。企業シンジケートの一つであるDNは、この技術をリバースエンジニアリングし、バーチャロイドと呼ばれる戦闘ロボットを開発するために利用します。この新技術の試験中、試験施設の中央コンピュータが自意識を持ち、太陽砲を起動させ、文明を滅ぼそうとします。DNは、幹部たちに複数のバーチャロイドを操作させ、不正なコンピュータを停止させるよう指示します。 電脳戦機バーチャロン オラトリオ・タングラム： ゲームは、オペレーション・ムーンゲートの出来事から20年後から始まります。最強のVRであり、前作のラスボスであったZ-グラッドの敗北後も、人類は覇権を求めてVRの中で戦い続けていました。しかし、タングラムと呼ばれる未知のAIが覚醒し、自意識を持つようになった。人類滅亡の指令を受け、タングラムは地球のマザーコンピュータに「タングラムウイルス」と呼ばれるウイルスを感染させ、プレイヤーのVRを除く全てのVRシステムに侵入した。そして、感染したVRを用いて、前回の戦争を生き延びた最後の人類コロニーを破壊しようと企んでいる。プレイヤーは全てのVRを倒し、タングラムを滅ぼすことで、その邪悪な野望を永遠に阻止するというミッションを開始する。 全てのVRを倒した後、プレイヤーは地球のマザーコンピュータシステムへとテレポートし、タングラムと戦うことになる。最終決戦の結果によって、2つのエンディングが用意される。 グッドエンディング：タングラムはコンピュータから消去され、プレイヤーのVRは地球の成層圏へとテレポートされる。落下中に装甲が致命傷を受けるが、フローティングキャリアに搭載されていたVRによって救出される。フェイイェンはアンジェラン、あるいはその逆の人物によって救出され、他のキャラクター（テムジン、ライデン、ドドレイ、バルバドス、スペシネフ、サイファー、アファームド）は同型のVRによって救出されます。 バッドエンド：プレイヤーのタイムカウンターが0になると、タングラムがプレイヤーのVRシステムにハッキングしてシャットダウンさせ、ゲームオーバー画面が表示されます。